伦理委员会和临床试验机构之间的合作建立在以下基础上：

法规和指导原则：伦理委员会和临床试验机构都必须遵守国家和地方的法规和指导原则，确保临床试验的伦理合规性。这些法规和指导原则规定了伦理委员会和临床试验机构的职责、权利和义务，为双方的合作提供了法律保障。

合同和协议：在进行医疗器械临床试验前，伦理委员会和临床试验机构通常会签订合作合同或协议。这些文件明确了双方的合作范围、职责分工、审查流程、保密义务等内容，为双方的合作提供了明确的指导和保障。

沟通与协作：伦理委员会和临床试验机构之间需要建立有效的沟通渠道和协作机制。这包括定期召开会议、及时交流信息、共同解决问题等。通过积极的沟通和协作，双方可以更好地理解彼此的需求和期望，确保临床试验的顺利进行。

相互信任与尊重：伦理委员会和临床试验机构之间需要建立相互信任与尊重的关系。伦理委员会应尊重临床试验机构的性和独立性，认可其在临床试验中的重要作用；同时，临床试验机构也应尊重伦理委员会的审查决定，遵守伦理原则和要求。

共同目标：伦理委员会和临床试验机构的终目标都是保护受试者的权益和安全，促进医疗器械临床试验的规范发展。双方应共同努力，为实现这一目标而合作。

综上所述，伦理委员会和临床试验机构之间的合作建立在法规、合同、沟通、信任和共同目标的基础上。通过有效的合作，双方可以确保医疗器械临床试验的伦理合规性，保护受试者的权益和安全，推动医疗器械的科学研究和创新。