申请菲律宾医疗器械许可证需要准备以下材料：

公司注册证书和工商营业执照等，证明申请者在菲律宾是合法注册的实体。

详细的产品技术文件，例如产品规格、使用说明、性能测试报告等。

质量管理体系证明，如ISO 13485等质量管理体系认证，以证明申请者具有合法或实际制造设施的质量体系。

符合菲律宾标准的产品检测报告，确保产品符合相关的质量和安全标准。

产品的广告和宣传材料，确保其内容符合菲律宾法规的要求。

如果产品属于高风险的医疗器械，可能需要提供相关的临床试验数据。

医疗器械注册申请表（Form FDA 1571）。

生产厂家的资质证明文件。

医疗器械的质量控制体系文件。

请注意，具体所需材料可能会因产品类型和注册程序而有所不同。在开始注册前，建议仔细阅读菲律宾有关医疗器械的法规，特别是《菲律宾医疗器械法》和FDA发布的相关准则，或者咨询相关机构，以确保对注册要求和程序有清晰的了解。

此外，提交的所有文件都需要是英文的，并且需要翻译成菲律宾语。同时，您还需要支付相应的注册费用，具体金额可能会因产品类型和注册程序的复杂性而有所不同。

后，提交完所有材料后，您需要等待菲律宾FDA的审批。审批时间可能会因产品类型和申请量的不同而有所不同，通常需要几个月到一年左右的时间。如果您的申请被批准，您将获得一份医疗器械注册证书，这意味着您的产品已经符合菲律宾的法规要求，并可以在菲律宾市场上合法销售。

希望这些信息对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时联系相关的注册代理公司或咨询公司。