办理医疗器械出口服务机构许可证通常需要准备以下材料：

企业营业执照副本及复印件。

医疗器械产品注册证书（如适用）。

医疗器械生产许可证（如适用）。

医疗器械产品出口销售证明登记表。

法定代表人或负责人的身份证明及学历或职称证明复印件。

组织机构与部门设置说明，包括质量管理部门和人员配置情况。

经营范围、经营方式说明，以及相关的经营计划或合同。

经营场所、库房地址的地理位置图、平面图、房屋产权证明文件或者租赁协议（附房屋产权证明文件）复印件。

经营设施、设备目录，包括用于医疗器械储存、运输和检验的设施和设备。

经营质量管理制度、工作程序等文件目录，以证明企业具备完善的质量管理体系。

计算机信息管理系统基本情况介绍和功能说明，以展示企业具备现代化的信息管理手段。

相关人员的备案信息，包括人员的资格证书和工作经验证明。

材料真实性的承诺书，确保所提交的材料真实、准确、完整。

此外，根据具体的医疗器械类别和出口目的地国家的要求，可能还需要提供其他特定的证明文件或资料。因此，在准备材料时，建议参考相关法律法规和监管部门的要求，并咨询的医疗器械出口服务机构或律师，以确保所提交的材料符合规定。

请注意，不同地区的监管部门可能对所需材料有所差异，因此在实际办理过程中，好先向当地食品药品监督管理部门或相关机构咨询具体的办理要求和流程。