进口三类医疗器械在国内进行临床试验的申请流程通常涉及多个环节，以下是主要步骤的概述：

首先，申请人需要准备详细的申请材料。这些材料包括但不限于试验方案、研究计划、伦理委员会批准文件、研究人员资质证明、知情同意书等。这些文件应全面描述试验的目的、方法、过程以及预期结果，并确保符合相关法规和伦理要求。

其次，申请人需要选择合适的临床试验中心和机构，并与相关研究人员和机构建立联系。这些机构应具备进行试验所需的条件和资源，并能确保试验的顺利进行。

接下来，申请人需要向伦理委员会提交试验方案和相关文件进行伦理审查。伦理委员会将评估试验的伦理合规性，包括受试者的权益保护、试验的风险与受益比等。一旦获得伦理委员会的批准，申请人可以开始进行临床试验的准备工作。

同时，根据所在国家/地区的监管要求，申请人可能还需要向相关监管机构提交临床试验申请，并获得其批准或许可。

在试验开始之前，申请人应确保参与试验的研究人员接受相关的试验培训，以确保他们具备进行试验所需的知识和技能。

在试验执行阶段，申请人需要按照试验方案的要求，将符合入选标准的受试者纳入试验，并进行随访和数据收集。同时，申请人应确保试验的监测和质量控制，确保试验的进行符合规定和要求。

在试验完成后，申请人需要对收集的数据进行分析和统计，评估试验的主要结果和指标，并撰写试验报告。这份报告需要提交给相关机构和监管机构进行审查和评估。

需要注意的是，整个申请流程可能因国家、地区以及具体情况的不同而有所变化。因此，建议申请人在进行进口三类医疗器械临床试验的申请前，仔细研究目标市场的相关法规和要求，并与当地的药品监管部门或机构进行沟通和咨询，以确保流程的合规性和顺利进行。