体系认证和工厂审查在多个方面存在明显的区别，这些区别主要体现在目的、范围、方法、结果以及执行机构等方面。

体系认证：主要目的是通过统一的、系统的、规范的方法，对一个组织的体系是否达到特定的标准进行评估和审查，并由第三方机构颁发认证证书。这有助于提高组织的管理水平和运营能力，增强组织的竞争力和信誉度。

工厂审查：则更侧重于对工厂的综合评估，包括其合法性、生产能力、质量控制体系、员工权益保护等多个方面。目的是确保工厂符合相关法律法规和标准要求，保障产品质量和员工权益。

体系认证：通常涉及组织整体的管理体系，如质量管理体系（ISO 9001）、环境管理体系（ISO 14001）、职业健康安全管理体系（ISO 45001）等，覆盖组织的所有部门和活动。

工厂审查：则更侧重于工厂的具体运营情况，包括生产现场、设备、工艺流程、产品质量、员工工作条件等。

体系认证：采用文件审核和现场审核相结合的方式。首先，认证机构会对组织提交的文件进行初审，检查是否符合认证标准；然后，进行现场检查，评估组织的实际运营情况。

工厂审查：则可能包括前期准备（如收集工厂信息）、现场审查（如查看生产现场、设备、工艺流程等）、文件审查（如核对生产记录、检验报告等）以及员工访谈等多个环节。

体系认证：如果组织符合认证标准，认证机构将颁发认证证书，并在一定的时间范围内进行监督和审核，以确保组织的体系持续符合标准要求。

工厂审查：则根据审查结果编写审厂报告，提出改进意见和建议。这些意见和建议可能涉及工厂的生产流程、设备更新、员工培训等多个方面。

体系认证：通常由具有资质的第三方认证机构执行，这些机构经过国家认可或国际互认，具备进行体系认证的能力和资格。

工厂审查：可能由政府机构、行业协会、客户或第三方审核机构等执行，具体取决于审查的目的和范围。

综上所述，体系认证和工厂审查在目的、范围、方法、结果以及执行机构等方面都存在明显的区别。企业在选择进行体系认证或工厂审查时，应根据自身的需求和目标来确定合适的方案。