办理二类医疗器械变更注册的流程如下：

申请人需要准备申请材料，包括申请表、证明性文件、注册人关于变更情况的声明、原医疗器械注册证及其附件复印件、历次医疗器械注册变更文件复印件、企业名称变更核准通知书和/或相应详细变更情况说明及相应证明文件等材料。

申请人需要将准备好的申请材料提交给相应的监管机构。

监管机构将对提交的申请进行审核和评估，并做出审批决定。如果产品继续符合相关法规和标准，监管机构将颁发新的医疗器械注册证，有效期通常与原注册证相同。

需要注意的是，在变更注册过程中，企业需要遵守相关法规和规定，确保提交的文件和资料真实、完整、准确。同时，企业还需要加强质量管理体系建设，确保产品质量可控、可追溯，并遵守相关法规和标准要求，确保产品的合规性和可靠性。

办理二类医疗器械变更注册的具体流程可能会因地区和监管机构的不同而有所差异。因此，建议企业在办理变更注册前，仔细阅读相关法规和规定，了解具体流程和要求，并咨询人士的意见。