东南亚注册医疗器械不一定需要FDA认证。FDA认证主要是美国食品和药物管理局对食品、药品、医疗器械等进行的监督检验，其认证范围主要在美国境内。

然而，东南亚各国的医疗器械注册和监管标准可能因国家而异。例如，泰国的医疗器械市场由泰国食品和药物管理局（FDA）监管，但这里的FDA与美国FDA并不相同。新加坡、越南和菲律宾等国的医疗器械市场也都有各自的监管机构和注册要求。

因此，在东南亚注册医疗器械时，应首先了解目标国家的具体法规和要求。制造商或供应商需要按照目标国家的规定准备技术文件、提交注册申请，并可能需要接受审核和评估。虽然FDA认证不是东南亚注册医疗器械的必要条件，但一些国家可能要求医疗器械符合或进行类似的安全性和有效性评估。

总之，为了确保合规并顺利进入市场，建议制造商在计划进入东南亚市场前，详细了解目标国家的医疗器械注册和监管要求，并咨询当地的法规顾问或医疗器械注册机构。