一般来说，临床试验申请表相对于医疗器械注册申请表可能更为复杂。

医疗器械注册申请表主要关注的是医疗器械的基本信息、制造商信息、技术规格以及符合相关法规和标准的情况。尽管它需要提供详尽的产品和企业信息，但其流程相对固定，只要按照要求提供必要的信息和文件，通常可以完成注册申请。

而临床试验申请表涉及的内容则更为深入和广泛。临床试验是对医疗器械在人体上的安全性和有效性进行直接评估的过程，因此其申请表的填写需要更加严谨和细致。申请人需要详细描述试验的目的、设计、方法、样本量、数据收集和分析等内容，同时还需要提供伦理审查、药物监管部门的批准以及招募试验参与者的计划等。此外，临床试验的数据需要真实可靠，这通常需要寻求第三方实验机构的支持，并进行严格的实验验证。

因此，从内容和流程上来看，临床试验申请表可能更为复杂。不过，具体的复杂度也会因不同的医疗器械类型、风险等级以及国家和地区的法规要求而有所差异。在填写这两种申请表时，建议申请人仔细研究相关法规和标准，确保申请表的准确性和合规性。