医疗器械经营许可证和药品经营许可证在多个方面存在明显的区别。以下是对这两个证件的主要区别的详细分析，并按照清晰的格式进行归纳：

一、审批主管部门

医疗器械经营许可证：由国家药品监督管理局的相关分支机构（如食品药品监管部门）负责审批。

药品经营许可证：直接由国家药品监督管理局负责审批。

二、申请条件

医疗器械经营许可证：

申请人需具备相应的医疗器械销售经验和资质。

需提供相关的产品质量认证文件。

药品经营许可证：

申请人需具备药学背景。

需通过相关考试获得相应的资质认证。

三、经营范围

医疗器械经营许可证：

适用于医疗器械经营企业，特别是第二类和第三类医疗器械的经营企业。

第二类医疗器械包括血压计、血糖仪等；第三类医疗器械包括植入式心脏起搏器等。

药品经营许可证：

经营范围包括麻醉药品、精神药品、医疗用毒性药品、生物制品、中药材、中药饮片、中成药、化学原料药及其制剂、抗生素原料药及其制剂、生化药品等。

四、经营许可的具体要求

医疗器械经营许可证：

企业需符合《医疗器械经营监督管理办法》的相关规定，包括具有与经营范围和经营规模相适应的质量管理机构或人员、经营场所和贮存条件等。

涉及第三类医疗器械经营的企业还需具有符合要求的计算机信息管理系统。

药品经营许可证：

药品批发企业需具有保证药品质量的规章制度、相适应的储存设施、独立的计算机管理信息系统等。

质量负责人需具有大学以上学历，且必须是执业药师。

五、法律法规依据

医疗器械经营许可证：主要依据《医疗器械监督管理条例》和《医疗器械经营监督管理办法》等相关法规。

药品经营许可证：主要依据《药品管理法》等相关法规。

综上所述，医疗器械经营许可证和药品经营许可证在审批主管部门、申请条件、经营范围、经营许可的具体要求以及法律法规依据等方面存在显著的差异。这些差异体现了医疗器械和药品在监管和管理上的不同需求和标准。