申请菲律宾医疗器械许可证的过程大致如下：

1. 准备文件：收集并准备所有必要的文件和信息。这些文件包括但不限于产品描述、技术规格、制造过程、质量控制、临床数据（如果适用）、ISO 13485认证等。确保文件的准确性和完整性。

2. 选择注册类别：根据产品类型，选择适当的注册类别。菲律宾通常将医疗器械分为不同的类别，每个类别可能有不同的要求。

3. 设立法定代理人：如果是外国生产商，需要在菲律宾指定一个法定代理人，负责在菲律宾境内与FDA的沟通和协调。

4. 提交申请：向菲律宾FDA提交完整的注册申请，包括所有必要的文件和信息。确保文件的准确性和完整性。

5. 初步审查：FDA将对提交的文件进行初步审查，以确保其完整性和符合法规。

6. 技术评估：进行技术评估，包括对产品的性能、质量控制体系、安全性和有效性的评估。

7. 临床评估（如果适用）：如果产品需要进行临床评估，FDA将对临床数据进行审查以确保产品的安全性和有效性。

8. 支付注册费用：缴纳相应的医疗器械注册费用。费用的具体金额可能因产品类型和注册程序而有所不同。

9. 等待审批：等待菲律宾FDA对注册申请的审批。审批时间可能因产品类别和流程复杂性而有所不同。

10. 获得注册证书：一旦注册申请获得批准，将收到医疗器械注册证书，证明产品已被批准在菲律宾市场上销售和使用。

请注意，以上步骤仅为一般性指南，具体要求可能会因产品类型、注册类别和法规的变化而异。为确保准确性和及时性，建议在注册之前咨询的法规咨询机构或直接联系菲律宾FDA。此外，FDA可能会对其流程进行更新，因此随时了解新信息是很重要的。