第三类医疗器械备案和审批流程的主要区别在于其适用范围、流程复杂性以及所需时间等方面。

首先，从适用范围来看，备案主要适用于那些风险较低、安全性已经得到广泛认可的医疗器械，流程相对简化，更注重产品的基本信息和合规性检查。而审批则主要适用于那些风险较高、安全性需要进一步验证的医疗器械，流程更为严格和复杂，需要进行深入的技术审查和安全性评价。

其次，从流程复杂性来看，备案流程通常包括提交备案申请、资料审核等步骤，而审批流程则在此基础上增加了更为详细的技术评审、现场检查等环节。审批过程中，可能还需要进行临床试验以验证产品的安全性和有效性。

后，从所需时间来看，由于审批流程更为复杂，涉及的技术审查和安全性评价更为深入，因此审批所需的时间通常会比备案更长。

总的来说，第三类医疗器械备案和审批流程在适用范围、流程复杂性和所需时间等方面存在明显的区别。具体选择哪种流程，需要根据产品的风险等级、安全性要求以及市场准入需求等因素进行综合考虑。同时，为了确保流程的顺利进行，建议企业在申请前仔细查阅相关的法规和指导文件，并与的医疗器械咨询机构或律师保持沟通。